目前，由于各种客观条件的限制，政策法规的不配套，以及人们对审计法理解的偏见，审计职能还不能完全发挥，利用外资审计工作为经济建设服务还将遇到许多新的矛盾和问题，有待于我们去探讨、研究。
1.外资审计职能的发挥受各级政府的限制。《审计法》已对审计对象和审计范围作了明确的规定，但有些政府部门却对此的理解出现偏差，以保护发展的名义限制审计职能的发挥，似乎审计与发展是直接对立的，会阻碍发展的进程，有审计就不可能发展，否定了审计的作用，使审计的威慑力受到了限制。
2.外资审计监督处罚力度和法规建设的削弱问题。从现有的各种法律法规的规定来看，审计直接对违纪行为进行处罚的力度有削弱的趋势，片面地理解与国际接轨就是发挥审计公证职能。我们认为根据我国的现实经济和社会状况，没有强硬的审计执法手段做后盾，审计就没有能力去纠正有损于国家利益的违纪行为，就不可能真正为改革开放服务，审计公证也在某种程度上流于形式。因此，建立健全审计处罚的法规制度是必不可少的法律措施和法律保证，是审计为经济建设服务的前提。
3.外资审计风险防范问题。随着世界银行对贷款项目检查力度的加强，审计风险的防范问题也日益突出，审计风险越来越受到各级审计机关的重视。但由于以前我们实行的是内外有别的审计报告制度，留下了很多一时难以解决的问题，尽管自2000年起已全面停止了内外有别实行了内外合一的审计报告制度，但在实际工作中内外有别的思想仍对审计工作有着重要的影响，截留审计中发现的问题的现象时有发生，审计风险问题依然很严重。
总之，外资审计是一项艰巨而光荣的任务，我们要在作好正常审计工作的同时，利用外资审计工作的特点为经济建设服务，要注意加强外资审计成果的综合利用和分析研究，针对审计中发现的问题提出具体的建设性意见和建议，达到通过审计促进积极、合理地利用外资，使外资审计真正为大量利用外资作出应有的贡献。
